TBMM Başkanvekili Bekir Bozdağ, vefat ve başsağlığı mesajında şu ifadeleri kullandı: "22 ve 23’üncü dönem Afyonkarahisar milletvekilimiz Halil Aydoğan’ın vefatını üzüntüyle öğrendim.
Merhum Halil Aydoğan kardeşime Allah’tan rahmet, ailesine başsağlığı ve sabır diliyorum. Rabbimiz, merhameti ve mağfiretiyle muamele eylesin. Mekanı Cennet,makamı âlî olsun,inşallâh.